O técnico do Plymouth Argyle perdeu a cabeça durante a vitória por 2 a 1 sobre o Blackburn na última vez.
Rooney ficou furioso depois que a estrela do Rovers, Joe Rankin-Costello, cabeceou para o empate aos 86 minutos, alegando que havia sido uma falta na preparação.
A lenda da Inglaterra e do Manchester United perdeu a paciência e foi vista tendo uma conversa acalorada com o quarto árbitro Jacob Miles.
Ele então chamou o árbitro James Linington, que mandou Rooney para a arquibancada.
Mas a equipe de Devon riu por último quando Morgan Whittaker apareceu com uma vitória aos 97 minutos que os levou a subir para o 14º lugar no campeonato.
Rooney voltou a campo após o jogo para comemorar com seus jogadores e torcedores.
A FA revelou sua punição em um comunicado que dizia: “Foi alegado que a conduta do técnico por volta dos 87 minutos foi imprópria e/ou ele usou palavras abusivas e/ou insultuosas contra um árbitro, o que levou à sua demissão.
“Foi ainda alegado que após a sua demissão a sua conduta foi imprópria e/ou violenta.
“Também foi alegado que, ao retornar ao campo de jogo após ser expulso, seu comportamento foi impróprio”.
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“Rooney admitiu esta acusação e uma Comissão Reguladora independente impôs as suas sanções após uma audiência.”
Ele não estará no banco de reservas amanhã contra o Cardiff.
Abrindo sobre a vitória sobre o Blackburn e a expulsão, Rooney disse ao talkSPORT: “Eu e o secretário do clube no túnel estávamos comemorando, quebrei os óculos dele comemorando.
“Portanto, a vitória foi merecida – mas às vezes transborda um pouco e essa é a natureza do futebol.
“Foi a minha primeira vez como treinador [getting sent off].
“Acho que, como técnico ou treinador principal, as decisões acontecem em campo e, olhando para trás, é uma cobrança de falta, então o gol não deveria ter sido válido.
“No campeonato você não tem VAR, então os árbitros sentiram falta e suas emoções surgiram e você sabe, sou uma pessoa apaixonada, queremos vencer.
“Trabalhamos muito duro para vencer o jogo e ver isso eliminado pelo que considero um erro dos árbitros, achei muito duro.
“Reagi de uma maneira que não deveria e o cartão vermelho foi merecido.
“Do meu ponto de vista, os adeptos foram fantásticos, quase galvanizaram os jogadores e o estádio e continuámos a pressionar para conseguir o golo da vitória.”