Pete Shuttleworth deixou o cargo de número 2 de Rooney por motivos pessoais – provocando uma reviravolta nos bastidores de Argyle.
E Rooney decidiu contratar Phelan, que trabalhou com a lenda do Manchester United em Old Trafford sob o comando de Sir Alex Ferguson.
Rooney disse: “Estou triste por ver Pete deixar o clube.
“Ele é alguém com quem trabalhei de perto ao longo de minha carreira gerencial, tendo me conhecido no Derby County e também é um amigo próximo.
“Pete tem alguns assuntos pessoais em andamento e é onde seu foco precisa estar e todos nós respeitamos isso completamente e decidimos mutuamente nos separar.
“Mike é alguém que conheço bem, tendo trabalhado com ele quando era jogador do Manchester United e ele tem uma vasta experiência no mais alto nível do futebol.
“Estou muito satisfeito em trazê-lo para Argyle e espero vê-lo começar a trabalhar imediatamente.”
Phelan passou cinco temporadas no United, de 2008 a 2012, sob o comando de Fergie, vencendo a Premier League e a Liga dos Campeões juntas.
Ele então se mudou para Norwich e também passou pelo Hull antes de retornar ao United em 2018 por mais quatro anos.
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Phelan agora volta a treinar ao lado de Rooney, que está no comando do Plymouth desde maio.
O Argyle está em 22º lugar no campeonato e se encontra na zona de rebaixamento apenas pelo saldo de gols.
Mas eles não vencem há quatro jogos do campeonato, apesar de terem empatado em 2 a 2 com o Watford em casa no último jogo.