O atacante Savinho, de 20 anos, se tornou a última vítima na quarta-feira, ao chorar durante a derrota do Man City na Carabao Cup para o Tottenham.
O brasileiro ficará afastado por duas semanas devido a uma entorse no tornozelo.
Manuel Akanji também teve problemas físicos depois de sentir um ajuste no aquecimento antes do confronto com os Spurs, ao se juntar a uma série de craques na linha lateral.
Eles incluem Rodri, Kyle Walker, Jack Grealish, Jeremy Doku, Kevin de Bruyne, Manuel Akanji, Oscar Bobb e Josko Gvardiol.
As ausências deixam o Man City desesperadamente curto em termos de profundidade de elenco.
E Guardiola revelou que poderá ter que contar com os jogadores da sua academia nas próximas semanas.
Ele disse: “Isso acontece em muitos clubes e não somos o único clube do mundo a passar por isso. Há muitos [of injuries] em certos departamentos e cargos, mas é o que é.
“Estamos usando-os [the academy players] porque estamos em situação de emergência em determinados cargos, mas em alguns deles confiamos neles, como no passado.
“Eles nos ajudam, por isso a academia está aí… Às vezes não temos outras opções.”
ESPECIAL DE CASINO – MELHORES OFERTAS DE BEM-VINDO A CASINO
Os jovens Nico O’Reilly, James McAtee e Jacob Wright jogaram no meio da semana e podem jogar contra o Bournemouth no sábado.
Guardiola espera que vários problemas de lesões da sua equipa sejam resolvidos até ao virar do ano.
Ele acrescentou: “Talvez em janeiro tenhamos todos os jogadores de volta, exceto Rodri.
“Quando estamos todos juntos, o plantel é suficiente, quando totalmente concentrado e em forma.
“Por enquanto só temos que tentar recuperar os jogadores o mais rápido possível e então veremos.”
Após a viagem ao Bournemouth, o Man City viaja para o Sporting de Lisboa na Liga dos Campeões, enquanto se testa contra o novo técnico do Manchester United, Ruben Amorim.
O último jogo antes da pausa internacional será em Brighton, no dia 9 de novembro.