Lutador do campeonato, o City contratou o espanhol uma semana depois de demitir o ex-chefe do Hamburgo, Tim Walter.
Selles, 41, guiou o Reading até a vaga no play-off da League One.
Agora Hull concedeu-lhe um contrato de dois anos e meio como treinador principal.
Selles deixou o cargo de assistente técnico do FC Copenhagen para sua primeira função no futebol inglês em junho de 2022.
Foi quando Ralph Hasenhuttl fez dele o número 2 em Southampton.
Selles tornou-se chefe interino quando Hasenhüttl foi demitido cinco meses depois.
Nathan Jones, o próximo técnico permanente do Saints, durou apenas de novembro de 2022 a fevereiro de 2023.
E Selles conseguiu o cargo novamente, desta vez de forma interina, pelo resto da temporada.
Mas ele não conseguiu manter o Southampton no Prem e eles se recusaram a renovar seu contrato – com o atual técnico Russell Martin assumindo o cargo em junho de 2023.
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Selles assumiu o comando do Reading naquele mesmo mês – antes de voltar a subir de divisão com os Tigers.
Ele disse ao site de Hull: “Estou muito feliz. Quando a possibilidade de vir aqui se tornou real, meus olhos estavam voltados para Hull City.
“Conheço a equipa, o clube, a história e estou ansioso por começar a minha jornada com a equipa.
“Vi muitas semelhanças entre a nossa posição como equipa técnica e o que queremos fazer no presente e no futuro, e foi por isso que decidi vir.”
Andy Dawson permanecerá como chefe interino em casa contra o Blackburn no sábado, com Selles assumindo o comando contra o visitante Watford na próxima quarta-feira.
Isso significa que ele terá conseguido chegar às três primeiras divisões no espaço de dois anos – todas com times diferentes.
Enquanto isso, os Royals promoveram o chefe dos Sub-21, Noel Hunt, a chefe do time principal com contrato até 2027.